全球首个作物黄萎病菌资源和基因组数据库上线

全球首个作物黄萎病菌资源和基因组数据库上线
剑据中国农科院最新消息,该院植物保护研讨所作物黄萎病研讨团队与美国加州大学戴维斯分校联合牵头的“全球黄萎病菌基因组研讨”方案获得重要发展,建立了世界上第一个作物黄萎病菌资源和基因组数据库(Verticilli-Omics),并正式上线。用户可在该网站查阅录入的菌种资源信息、测序基因组可视化展现、数据发掘和剖析等。 团队首席戴小枫研讨员介绍,黄萎病被称为植物“癌症”。作为引起黄萎病的病原真菌,大丽轮枝菌是一种毁灭性的土传病原真菌,可侵染包含棉花、马铃薯、多种蔬菜瓜果和林木等在内的600多种植物,年均形成丢失近百亿美元;与马铃薯晚疫病并列为世界头号检疫目标。该病原难以防控的重要原因是种群结构杂乱,农业生产实践中短少分子盛行检测技能。 针对这一难题,团队联合国内外16家科研机构展开协同攻关,构建了迄今为止来历最丰厚的菌种资源库,发起了“全球黄萎病菌基因组研讨”方案。现在已完结基因组解析作业(全基因组159株、重测序3624株),建立了Verticilli-Omics数据库1.0版别并开端线上运转。该数据库录入了来历于10个国家的26个寄主共8102份黄萎病菌菌种资源;释放了159个大丽轮枝菌全基因组数据,占现在全球已释扩大丽轮枝菌基因组总数的85%;建立了基因组可视化、基因功能检索、基因比对等剖析渠道。团队现在还在建立Verticilli-Omics数据库2.0版别,首要展现全球大丽轮枝菌遗传变异组数据。 该项研讨得到国家要点研制方案政府间世界科技立异协作要点专项、中国农科院科技立异工程等项目支撑。

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